Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fndc1E9Q043 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fndc1E9Q043 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms