Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ryr1E9PZQ0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms