Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gcom1E9PZ54 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gcom1E9PZ54 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms