Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rsph10bE9PYQ0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsph10bE9PYQ0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms