Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54bE9PXC0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54bE9PXC0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54bE9PXC0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54bE9PXC0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54bE9PXC0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54bE9PXC0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54bE9PXC0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp54bE9PXC0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp54bE9PXC0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp54bE9PXC0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp54bE9PXC0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp54bE9PXC0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp54bE9PXC0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp54bE9PXC0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp54bE9PXC0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp54bE9PXC0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp54bE9PXC0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp54bE9PXC0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp54bE9PXC0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp54bE9PXC0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp54bE9PXC0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp54bE9PXC0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp54bE9PXC0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp54bE9PXC0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp54bE9PXC0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp54bE9PXC0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srp54bE9PXC0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms