Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rsf1E9PWW9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rsf1E9PWW9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms