Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc8E9PWG2 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms