Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc17E9PVB5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms