Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc175E9PVB3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms