Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Soga1E1U8D0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Soga1E1U8D0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Soga1E1U8D0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Soga1E1U8D0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Soga1E1U8D0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Soga1E1U8D0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Soga1E1U8D0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Soga1E1U8D0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms