Protein–RNA interactions for Protein: E0CYV9

1110002E22Rik, RIKEN cDNA 1110002E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1110002E22RikE0CYV9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1110002E22RikE0CYV9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1110002E22RikE0CYV9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1110002E22RikE0CYV9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
1110002E22RikE0CYV9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1110002E22RikE0CYV9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1110002E22RikE0CYV9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1110002E22RikE0CYV9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1110002E22RikE0CYV9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1110002E22RikE0CYV9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1110002E22RikE0CYV9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1110002E22RikE0CYV9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
1110002E22RikE0CYV9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1110002E22RikE0CYV9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1110002E22RikE0CYV9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1110002E22RikE0CYV9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1110002E22RikE0CYV9 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1110002E22RikE0CYV9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1110002E22RikE0CYV9 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1110002E22RikE0CYV9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1110002E22RikE0CYV9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1110002E22RikE0CYV9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1110002E22RikE0CYV9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1110002E22RikE0CYV9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1110002E22RikE0CYV9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1110002E22RikE0CYV9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1110002E22RikE0CYV9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1110002E22RikE0CYV9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1110002E22RikE0CYV9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
1110002E22RikE0CYV9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1110002E22RikE0CYV9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1110002E22RikE0CYV9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1110002E22RikE0CYV9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1110002E22RikE0CYV9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
1110002E22RikE0CYV9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1110002E22RikE0CYV9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1110002E22RikE0CYV9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms