Protein–RNA interactions for Protein: D4PHA7

Wscd2, WSC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wscd2D4PHA7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wscd2D4PHA7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wscd2D4PHA7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wscd2D4PHA7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wscd2D4PHA7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wscd2D4PHA7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wscd2D4PHA7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wscd2D4PHA7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wscd2D4PHA7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wscd2D4PHA7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wscd2D4PHA7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wscd2D4PHA7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wscd2D4PHA7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wscd2D4PHA7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wscd2D4PHA7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wscd2D4PHA7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wscd2D4PHA7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wscd2D4PHA7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Wscd2D4PHA7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Wscd2D4PHA7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Wscd2D4PHA7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Wscd2D4PHA7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Wscd2D4PHA7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Wscd2D4PHA7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Wscd2D4PHA7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Wscd2D4PHA7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Wscd2D4PHA7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Wscd2D4PHA7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wscd2D4PHA7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms