Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rdh8D3Z6W3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rdh8D3Z6W3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rdh8D3Z6W3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rdh8D3Z6W3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rdh8D3Z6W3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rdh8D3Z6W3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rdh8D3Z6W3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh8D3Z6W3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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