Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms