Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms