Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samd1D3YXK1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd1D3YXK1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms