Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rexo5D3YW29 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Rexo5D3YW29 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Rexo5D3YW29 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Rexo5D3YW29 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Rexo5D3YW29 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Rexo5D3YW29 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
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Rexo5D3YW29 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Rexo5D3YW29 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Rexo5D3YW29 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Rexo5D3YW29 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rexo5D3YW29 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms