Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc13D3YV10 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms