Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna7C0LLJ0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna7C0LLJ0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms