Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nxpe3B9EKK6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nxpe3B9EKK6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms