Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mterf1bB9EJ57 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf1bB9EJ57 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms