Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cfap58B2RW38 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap58B2RW38 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms