Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apba1B2RUJ5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms