Protein–RNA interactions for Protein: B2RUD9

Gm4787, MCG140564, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4787B2RUD9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm4787B2RUD9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm4787B2RUD9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms