Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprbB2RU80 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PtprbB2RU80 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms