Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf518aB2RRF6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Znf518aB2RRF6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms