Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Uhrf1bp1B2KF50 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uhrf1bp1B2KF50 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms