Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Brpf3B2KF05 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brpf3B2KF05 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms