Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mbd5B1AYB6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mbd5B1AYB6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms