Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3aB1AWZ3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms