Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf25B1AWN9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf25B1AWN9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms