Protein–RNA interactions for Protein: B1AUS7

Ssxa1, Protein SSXA1, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxa1B1AUS7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssxa1B1AUS7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms