Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik3B1AS29 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms