Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prr29B1ARI9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms