Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slfn8B1ARD8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slfn8B1ARD8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms