Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rhox1B1APN4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rhox1B1APN4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms