Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M5A7VMS3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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