Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gbp4A4UUI3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4A4UUI3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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