Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Plcb2A3KGF7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Plcb2A3KGF7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Plcb2A3KGF7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Plcb2A3KGF7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Plcb2A3KGF7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Plcb2A3KGF7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Plcb2A3KGF7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms