Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samt1A2BED8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms