Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtf1A2AQ19 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms