Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtcflA2APF3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtcflA2APF3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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