Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GabreA2AMW3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GabreA2AMW3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms