Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Frmpd1A2AKB4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Frmpd1A2AKB4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
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