Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rhbdl2A2AGA4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhbdl2A2AGA4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms