Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col9a3A2ACT7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a3A2ACT7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms