Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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PtprfA2A8L5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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PtprfA2A8L5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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PtprfA2A8L5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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PtprfA2A8L5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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PtprfA2A8L5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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PtprfA2A8L5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprfA2A8L5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms