Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdc27A2A6Q5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms