Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo47A2A6H3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms