Protein–RNA interactions for Protein: A1L0T3

Ssc4d, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc4dA1L0T3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssc4dA1L0T3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms